پژوهشگران دانشگاه واشنگتن جهت نخستین بار موفق به اختراع یک پروتئین شده‌اند که می‌تواند با شکاف‌هایی که در ساختار خود دارد، به مولکول نشانه متصل و با آن همراه شو
ابداع نخستین پروتئین قابل اتصال به مولکول
عبارات مهم : اتصال
به گزارش ایسنا و به نقل از ساینس دیلی، محققان جهت نخستین بار موفق به ایجاد یک پروتئین قادر به اتصال به یک مولکول نشانه کوچک شده است اند.
دانشمندان دانشکده پزشکی دانشگاه واشنگتن یک پروتئین استوانه ای به نام “بتا بشکه”(beta barrel) ایجاد کرده اند که دارای حفره هایی جهت اتصال به نشانه است.
ابداع نخستین پروتئین قابل اتصال به مولکول
پروتئین ایجاد شده است قادر به اتصال و فعال کردن یک ترکیب مشابه با آن در داخل پروتئین فلورسنت سبز هست. این یک گام بزرگ جهت علم هست، جایی که تلاش های قبلی جهت ساخت پروتئین های با توانایی اتصال به مولکول های کوچک به نتیجه نرسیده بود.
این پیشرفت، پنجره هایی را جهت دانشمندان باز می کند که بتوانند پروتئین ها را بر خلاف دیگر قاعده محیط زیست ایجاد کنند. این پروتئین ها می توانند با دقت اوج و توانایی اتصال به اهداف کوچک مولکولی خاص ساخته شوند.
پژوهشگران دانشگاه واشنگتن جهت نخستین بار موفق به اختراع یک پروتئین شده‌اند که می‌تواند با شکاف‌هایی که در ساختار خود دارد، به مولکول نشانه متصل و با آن همراه شو
این کار با روش “شکاف” یا “de novo” ممکن شده است هست. تکنیکی که توانایی و کاربردهای بالقوه فراوانی در تحقیقات، پزشکی و صنعت دارد.
“دیوید بیکر” محقق ارشد این مطالعه گفت: استفاده از طرح موفقیت آمیز “شکاف” در ایجاد پروتئین های سفارشی با توانایی اتصال به مولکول های کوچک، مرحله ای جهت ایجاد پروتئین های پیچیده ای است که محدودیت ها را از میان برمی دارد.
دانشمندان باید یک پروتئین به شکل سیلندر به نام “بتا-بشکه” ایجاد می کردند. شکل مناسب این پروتئین، کاملا در جهت انجام وظیفه آن هست، آیا که یک انتهای سیلندر جهت تثبیت پروتئین و انتهای دیگر به عنوان یک نقطه اتصال به مولکول نشانه کار می کند.
ابداع نخستین پروتئین قابل اتصال به مولکول
دانشمندان از یک پلت فرم نرم افزاری موسوم به “روزتا”(Rosetta) استفاده کردند که در آزمایشگاه بیکر جهت طراحی پروتئین تازه توسعه داده شده است بود. این برنامه می تواند آینده نگری کند که یک زنجیره از اسیدهای آمینه بعد از سنتز به چه شکلی درمی آیند و می تواند آینده نگری کند که چگونه تغییرات اسید آمینه های متفاوت در طول زنجیره ممکن است شکل نهایی را عوض کردن دهد.
قدرت آینده نگری این برنامه امکان آزمایش ترکیبات متفاوت آمینو اسیدها را جهت طراحی پروتئین های با شکل و عملکرد مورد نظر فراهم می کند.
پژوهشگران دانشگاه واشنگتن جهت نخستین بار موفق به اختراع یک پروتئین شده‌اند که می‌تواند با شکاف‌هایی که در ساختار خود دارد، به مولکول نشانه متصل و با آن همراه شو
علاوه بر این نرم افزار پیش بینی، دانشمندان از یک الگوریتم اتصال قدرتمند تازه به نام “RIF”(Field Interaction Rotamer) استفاده می کنند که به وسیله “ویلیام شفلر”، یکی از دانشمندان ارشد پژوهشی آزمایشگاه بیکر ساخته شده است است.
این الگوریتم، تمام ساختارهای بالقوه شکاف های مورد نیاز جهت اتصال به مولکول های خاص را شناسایی می کند.
ابداع نخستین پروتئین قابل اتصال به مولکول
بیکر گفت: این پروتئین روی سلول های باکتریایی، مخمر و پستانداران کار می کند. نصف پروتئین فلورسنت سبز بودن باید جهت محققان بسیار بافایده باشد.
وی افزود که این روش به محققان اجازه می دهد مجموعه ای از ساختارهای پایه را به طور نامحدود و با اشکال سفارشی جهت اتصال به مولکول مورد علاقه خود کشف کنند.
وی ادامه داد: درک ما از عوامل تعیین کننده جهت اتصال پروتئین پیشرفت کرده است.
واژه های کلیدی: اتصال | پروتئین | استفاده | دانشمندان | اخبار پزشکی
دانلود فایل ها
توجه: ممکن است تمام لینک های دانلود به دستور مقام قضایی حذف شده باشد...
